Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3O43889 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3O43889 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3O43889 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CREB3O43889 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3O43889 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3O43889 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3O43889 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3O43889 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3O43889 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3O43889 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3O43889 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3O43889 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3O43889 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3O43889 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3O43889 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3O43889 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3O43889 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3O43889 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3O43889 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3O43889 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3O43889 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3O43889 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3O43889 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3O43889 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3O43889 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3O43889 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3O43889 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3O43889 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3O43889 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3O43889 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3O43889 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3O43889 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3O43889 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3O43889 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3O43889 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3O43889 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3O43889 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3O43889 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3O43889 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3O43889 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3O43889 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3O43889 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3O43889 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3O43889 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3O43889 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3O43889 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3O43889 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3O43889 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3O43889 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3O43889 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3O43889 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3O43889 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3O43889 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3O43889 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3O43889 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3O43889 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3O43889 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3O43889 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3O43889 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3O43889 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3O43889 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3O43889 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3O43889 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3O43889 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3O43889 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3O43889 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3O43889 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3O43889 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3O43889 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3O43889 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3O43889 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3O43889 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3O43889 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3O43889 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3O43889 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3O43889 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3O43889 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3O43889 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3O43889 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3O43889 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3O43889 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3O43889 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3O43889 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3O43889 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3O43889 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3O43889 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3O43889 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3O43889 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3O43889 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3O43889 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3O43889 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3O43889 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3O43889 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3O43889 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3O43889 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3O43889 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3O43889 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3O43889 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3O43889 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 287.4 ms