Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms