Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRXO43186 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRXO43186 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRXO43186 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRXO43186 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRXO43186 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRXO43186 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRXO43186 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRXO43186 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRXO43186 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CRXO43186 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRXO43186 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRXO43186 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRXO43186 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRXO43186 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRXO43186 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRXO43186 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRXO43186 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRXO43186 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRXO43186 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRXO43186 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRXO43186 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRXO43186 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRXO43186 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRXO43186 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRXO43186 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRXO43186 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRXO43186 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRXO43186 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRXO43186 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRXO43186 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRXO43186 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRXO43186 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRXO43186 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRXO43186 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRXO43186 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRXO43186 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRXO43186 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRXO43186 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRXO43186 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRXO43186 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRXO43186 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRXO43186 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRXO43186 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRXO43186 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRXO43186 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRXO43186 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRXO43186 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRXO43186 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRXO43186 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRXO43186 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRXO43186 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRXO43186 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRXO43186 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRXO43186 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRXO43186 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRXO43186 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRXO43186 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRXO43186 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRXO43186 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRXO43186 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRXO43186 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRXO43186 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRXO43186 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRXO43186 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRXO43186 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRXO43186 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRXO43186 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRXO43186 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRXO43186 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRXO43186 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRXO43186 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRXO43186 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRXO43186 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRXO43186 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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