Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBDO15205 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBDO15205 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBDO15205 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBDO15205 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBDO15205 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBDO15205 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBDO15205 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBDO15205 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBDO15205 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBDO15205 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBDO15205 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBDO15205 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBDO15205 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBDO15205 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBDO15205 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBDO15205 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
UBDO15205 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBDO15205 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBDO15205 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBDO15205 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBDO15205 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBDO15205 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBDO15205 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBDO15205 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBDO15205 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBDO15205 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBDO15205 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBDO15205 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBDO15205 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBDO15205 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBDO15205 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBDO15205 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBDO15205 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBDO15205 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBDO15205 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBDO15205 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBDO15205 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBDO15205 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBDO15205 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBDO15205 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBDO15205 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBDO15205 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBDO15205 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBDO15205 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
UBDO15205 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBDO15205 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBDO15205 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBDO15205 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBDO15205 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBDO15205 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBDO15205 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBDO15205 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBDO15205 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBDO15205 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBDO15205 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBDO15205 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBDO15205 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBDO15205 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBDO15205 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBDO15205 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBDO15205 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBDO15205 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBDO15205 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBDO15205 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBDO15205 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBDO15205 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBDO15205 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBDO15205 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBDO15205 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBDO15205 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBDO15205 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBDO15205 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBDO15205 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBDO15205 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBDO15205 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
UBDO15205 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBDO15205 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBDO15205 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBDO15205 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBDO15205 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBDO15205 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBDO15205 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBDO15205 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBDO15205 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBDO15205 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBDO15205 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBDO15205 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBDO15205 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBDO15205 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBDO15205 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBDO15205 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBDO15205 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBDO15205 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBDO15205 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBDO15205 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBDO15205 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBDO15205 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBDO15205 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBDO15205 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms