Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR1CO15160 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR1CO15160 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms