Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP290O15078 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP290O15078 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP290O15078 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP290O15078 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP290O15078 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP290O15078 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP290O15078 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP290O15078 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP290O15078 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP290O15078 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP290O15078 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP290O15078 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP290O15078 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP290O15078 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP290O15078 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP290O15078 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP290O15078 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP290O15078 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP290O15078 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP290O15078 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP290O15078 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP290O15078 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP290O15078 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP290O15078 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP290O15078 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP290O15078 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP290O15078 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP290O15078 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP290O15078 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP290O15078 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP290O15078 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP290O15078 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP290O15078 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP290O15078 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP290O15078 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP290O15078 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP290O15078 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP290O15078 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP290O15078 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP290O15078 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP290O15078 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP290O15078 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP290O15078 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP290O15078 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP290O15078 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP290O15078 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP290O15078 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP290O15078 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP290O15078 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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CEP290O15078 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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CEP290O15078 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP290O15078 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP290O15078 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP290O15078 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP290O15078 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP290O15078 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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CEP290O15078 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP290O15078 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP290O15078 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP290O15078 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP290O15078 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP290O15078 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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CEP290O15078 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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CEP290O15078 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP290O15078 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP290O15078 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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CEP290O15078 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP290O15078 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP290O15078 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP290O15078 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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CEP290O15078 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP290O15078 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP290O15078 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP290O15078 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP290O15078 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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CEP290O15078 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP290O15078 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP290O15078 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP290O15078 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP290O15078 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP290O15078 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP290O15078 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP290O15078 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP290O15078 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP290O15078 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP290O15078 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP290O15078 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP290O15078 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP290O15078 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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