Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCAMP3O14828 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SCAMP3O14828 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCAMP3O14828 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms