Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms