Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L21D6R901 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms