Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L4A6NCW7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms