Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTDP1Q9Y5B0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTDP1Q9Y5B0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms