Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms