Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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