Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms