Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCHIP1Q9P0W5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms