Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSD3Q9NYI0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms