Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FANCFQ9NPI8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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