Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE7BQ9NP56 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDE7BQ9NP56 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDE7BQ9NP56 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE7BQ9NP56 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE7BQ9NP56 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE7BQ9NP56 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE7BQ9NP56 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE7BQ9NP56 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE7BQ9NP56 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE7BQ9NP56 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE7BQ9NP56 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE7BQ9NP56 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE7BQ9NP56 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE7BQ9NP56 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE7BQ9NP56 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE7BQ9NP56 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE7BQ9NP56 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE7BQ9NP56 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE7BQ9NP56 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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