Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms