Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM54Q9BYV2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM54Q9BYV2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms