Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms