Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SALL3Q9BXA9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms