Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MESP1Q9BRJ9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms