Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PIK3R4Q99570 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms