Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP88Q99567 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP88Q99567 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP88Q99567 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP88Q99567 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP88Q99567 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP88Q99567 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP88Q99567 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP88Q99567 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP88Q99567 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP88Q99567 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP88Q99567 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP88Q99567 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP88Q99567 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP88Q99567 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP88Q99567 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms