Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms