Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SIN3AQ96ST3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms