Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS2Q96PQ0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms