Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms