Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf72Q96LT7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms