Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms