Protein–RNA interactions for Protein: Q92537

SUSD6, Sushi domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD6Q92537 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms