Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms