Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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