Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN12Q8IYM2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms