Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms