Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms