Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms