Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms