Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms