Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms