Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1LQ5PSV4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1LQ5PSV4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1LQ5PSV4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1LQ5PSV4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1LQ5PSV4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1LQ5PSV4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1LQ5PSV4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1LQ5PSV4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1LQ5PSV4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1LQ5PSV4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRMS1LQ5PSV4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRMS1LQ5PSV4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRMS1LQ5PSV4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms