Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PROX2Q3B8N5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PROX2Q3B8N5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PROX2Q3B8N5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PROX2Q3B8N5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PROX2Q3B8N5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PROX2Q3B8N5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PROX2Q3B8N5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PROX2Q3B8N5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PROX2Q3B8N5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PROX2Q3B8N5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PROX2Q3B8N5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PROX2Q3B8N5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PROX2Q3B8N5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PROX2Q3B8N5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PROX2Q3B8N5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PROX2Q3B8N5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PROX2Q3B8N5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PROX2Q3B8N5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PROX2Q3B8N5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PROX2Q3B8N5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PROX2Q3B8N5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PROX2Q3B8N5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms