Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms