Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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