Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
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