Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KLF1Q13351 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLF1Q13351 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KLF1Q13351 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLF1Q13351 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLF1Q13351 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLF1Q13351 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLF1Q13351 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLF1Q13351 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLF1Q13351 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLF1Q13351 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLF1Q13351 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLF1Q13351 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
KLF1Q13351 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLF1Q13351 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLF1Q13351 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KLF1Q13351 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLF1Q13351 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLF1Q13351 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLF1Q13351 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLF1Q13351 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLF1Q13351 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLF1Q13351 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLF1Q13351 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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