Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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