Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms