Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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